甲房地产开发公司2021年5月通过招拍挂方式取得项目住宅用地约200亩，按规定缴纳土地出让金，按照当地要求，需要配建廉租房，并取得廉租房划拨用地约15亩。甲公司进行分三期开发，2022年9月项目一期完工，开始销售并取得收入。2022年12月甲公司由于规划变更，将廉租房异地建设费上交政府，将原划拨的廉租房用地变性为住宅用地，并补交了15亩土地的出让金。公司财务在申报增值税时，出现了疑问，原来申报增值税时，还未发生补交15亩土地出让金事宜，现在如何将补缴的出让金可以在计算增值税时从销售额中抵减?
一、首先，我们可以肯定的是补交的15亩土地出让金，可以在计算增值税的时候，在销售额中抵减。
文件依据：国家税务总局公告2016年第18号
二、其次，是整体重新计算抵减还是在后续销售过程中进行抵减?
结合本案例，甲公司一期已经在取得销售收入的当期，已经将原来开发住宅用地的土地出让金在计算增值税时，已经在销售额中进行了抵减，但是由于时间差的问题，未将补交的15亩土地出让金在销售额中抵减。在实务操作中，存在两种处理方式：
1、在发生补交土地出让金的当期，财务一期已经抵减的土地价款全部重新计算，在补交当期，调整增值税纳税申报表和可抵减的土地价款;
2、在发生补缴土地出让金的当期，一期已经抵减的土地价款不在重新计算，而是在项目后期取得销售收入过程中，将补缴的土地出让金进行抵减。
以上两种处理方式均可，只是根据18号公告的文件，应于当期进行抵减，第二种计算方式，更切合文件精神。从企业角度来说，第一种计算方式，对于企业来说更有利。
